较真 – 热传的剑桥大学新冠病毒溯源报告,都有哪些问题?_腾讯新闻

较真 | 热传的剑桥大学新冠病毒溯源报告,都有哪些问题?_腾讯新闻
较真关键: 1剑桥大学的一项新研讨发现,在人类中最早呈现的原始版别的新冠病毒尽管呈现在武汉,可是并没有大规模盛行,而是在美国和澳大利亚更常见。相反地,在武汉盛行的新冠病毒是原始版别变异而来的另一类型。 2可是,该研讨受到了许多质疑。作者只选取了已揭露的6000余个新冠病毒基因组序列中的160个作为研讨目标,其间最陈旧类型的病毒在美国和澳大利亚盛行的样本量只要15个,代表欧洲广泛传达的病毒类型样本量只要11个,这种小规模样本得出的定论十分值得商讨。 3此外,该项研讨的研讨办法新,且研讨进行的条件“蝙蝠冠状病毒BatCovRaTG13悬殊新冠病毒在动物中的先人”还仅仅假定并不是既定现实,所以研讨定论并不能令人服气。再加上四个作者中有三个来自同一家庭,第三作者凭仗本身学术影响力推进研讨的宣布,该研讨更是受到了不少人的质疑。 4新冠病毒遗传进化剖析研讨只能供给病毒呈现的先后顺序的假定,并不能百分之百提醒病毒的来源地的这个问题。想要真实找到来源地,有必要找到病毒的中心宿主,以及在疾病迸发地找到疾病开端迸发时病毒感染人类的依据。 查证者:韩越丨剑桥大学病毒学博士后 一、剑桥大学的研讨阐明晰什么? 4月8日,剑桥大学研讨人员在美国国家科学院院刊(PNAS)上宣布了最新的关于新冠病毒(SARS-CoV-2)的几个变种和传达途径的研讨陈述。陈述首先将一种与新冠病毒的同源性高达96.2%的蝙蝠冠状病毒(即BatCovRaTG13病毒,由中科院武汉病毒所石正丽团队发现),设定为新冠病毒在动物中的先人,然后以此为参阅,对全球搜集的160 个完好的新冠病毒全基因组构建了新冠病毒的基因组发育网络。依照进化联系,样本中的新冠病毒分为了A、B、C三个类型。其间A类型与蝙蝠身上提取的病毒最为类似,归于更早版别的新冠病毒,B类型演化自A,C类型演化自B。 令研讨人员意外的是,作为最陈旧类型的A类型病毒,在武汉只要极少数事例,且包含一个在武汉日子的美国人,A类型病毒更多地是在美国和澳大利亚盛行。B类型病毒则是在我国境内盛行的首要类型,并且没有传达出东亚区域。C类型病毒首要在欧洲,香港,新加坡,韩国等地迸发,且没有在我国大陆呈现。 总结起来,该研讨的定论是:在人类中最早呈现的原始版别的新冠病毒A,尽管呈现在武汉,可是并没有大规模盛行,而是在美国和澳大利亚更常见。相反地,在武汉盛行的新冠病毒是原始版别变异而来的B类型。这样的定论一出,引起了网友们的广泛评论:这是不是阐明新冠病毒其实来源于美国?后来才输入武汉? 160个新冠病毒基因组的系统发育网络,图源自论文 其实早在二月份,我国科学院西双版纳热带植物园郁文彬团队就发布了类似的研讨成果。研讨者对全球搜集的93个新冠病毒基因组进行了剖析,并对病毒的传达途径作出了估测:武汉华南海鲜商场不是新冠病毒的来源地,新冠病毒或许最早于上一年11月中下旬就输入武汉,并开端人际传达,在华南海鲜商场加快了人际传达。 二、剑桥的新研讨——争议不小,缺点不少 关于剑桥大学宣布的最新研讨,在外国学者中也引起了不少的评论,爱丁堡大学的分子遗传进化学家和病毒学家Andrew Rambout就表明,剑桥大学的这份研讨在内容、定论和宣布途径上,都存在许多缺点。 Andrew Rambout关于剑桥大学的最新研讨成果表明质疑 那么详细的争议都有哪些呢? 1、 大多数学者以为研讨中包括的样本量太小了,不足以支撑上述的定论 剑桥大学和西双版纳植物园宣布的研讨中所用到的病毒基因组序列都来自禽流感病毒GISAID数据库。GISAID数据库最早是用来共享禽流感病毒序列的,意图是便利研讨者能够及时监控全球禽流感病毒的骤变状况。自2019年末新冠肺炎疫情迸发以来,GISAID多了一个新的用处:供以研讨者于榜首时间共享新冠病毒的基因序列。 到北京时间4月12日,GISAID中现已上传了6370个新冠病毒基因组序列,而剑桥这项研讨中,作者只选取了其间的160个病毒序列作为研讨目标。全球现在新冠肺炎的确诊人数现已挨近180万,用160个病毒基因组来揣度新冠病毒的来源和传达进程,明显不能让人服气。比方文中说到的最陈旧的A类型病毒,在美国和澳大利亚盛行的样本量只要15个;代表欧洲广泛传达的C类型病毒的样本量只要11个。根据这种小规模样本的定论,明显十分值得商讨。 截止北京时间4月12日,GISAID中测序的新冠病毒基因组数量现已到达6370个 2、 剑桥大学的研讨第二个值得商讨的当地是研讨的办法和定论 研讨中运用了单倍型网络(Haplotype network)的办法,剖析了新冠病毒的基因的多态性。值得注意的是,单倍型网络在古生物演化中被广泛运用,比方用来剖析人类来源,恐龙演化等问题。此次研讨是榜首次将单倍体网络的研讨办法运用在了病毒的基因剖析中,相应剖析成果的准确性还需要进一步的验证。 研讨中的理论假定也受到了许多质疑:在剑桥大学的研讨中,研讨人员将蝙蝠中已知与新冠病毒基因组类似性最高的冠状病毒(BatCovRaTG13病毒,类似度96.2%)设定为新冠病毒在动物中的先人。也悬殊说作者假定,这株病毒悬殊新冠病毒在动物中的先人,现在盛行的新冠病毒都是这个BatCovRaTG13病毒的子孙。打个比方,在剑桥大学的研讨中,作者确认BatCovRaTG13是植物的根,现在盛行于全球的新冠病毒是长在这个根上植物的茎和叶。尽管BatCovRaTG13和新冠病毒有96.2%的类似度,可是仍和现在的新冠病毒有1000多个碱基的不同,关于全基因组仅仅3万个碱基的新冠病毒来说,差异仍是巨大的。所以并不能确认蝙蝠带着的冠状病毒BatCovRaTG13悬殊新冠病毒的直系先人。在假定都值得商讨的状况下,研讨成果天然也并不会让人服气。爱丁堡大学的Andrew Rambout教授更是直言,正是由于BatCovRaTG13这个假定上的过错,整个研讨的成果也是彻底过错的。 Andrew Rambout在twitter上表明,剑桥大学研讨的假定是过错的 3、 许多人以为整个研讨宣布的进程也值得商讨 经过文章的作者列表能够看出,四个作者有三个作者都姓Forster,并且榜首作者和第二作者是夫妻,榜首作者和通讯作者是兄弟。尽管学术界将家人,夫妻的名字放在同一篇文章里的现象并不罕见,可是四个作者中有三个来自同一家庭的情形仍是十分罕见的。 而文章的第三作者,Colin Renfrew,其实是文章宣布的首要推进者。Colin平常的首要研讨方向是考古学,并不是病毒学,但却是院士等级的人物,在学术界十分有影响力。作为院士,除了惯例向期刊投稿这一宣布途径(submit),也能够使用自己的学术影响力主意向指定期刊投稿(contribute)。一般来讲,关于contribute文章的评定也不会像submit的文章那么严厉。这次宣布的研讨,悬殊Colin使用自己的影响力,主意向PNAS期刊contribute的文章,文章的宣布进程天然也受到了不少人的质疑。 剑桥大学研讨的作者名单 最终想要说到的一点是,新冠病毒遗传进化剖析这类的研讨,只能供给病毒呈现的先后顺序的假定,可是并不能百分之百提醒病毒的来源地的这个问题。想要真实揭开新冠病毒来源地的问题,有必要答复两个关键问题: 1、 将新冠病毒传染给人类的中心宿主究竟是什么? 2、 能否在疾病迸发地找到疾病开端迸发的时分病毒现已感染人类的依据(比方血清,人体安排标本等等)。 想了解更多内容?微信查找“腾讯较真驳斥谣言”小程序,点击“问答”进行发问,较真妹等你哦~参阅文献详见本文的微信版别. 版权声明:本文系腾讯较真独家稿件,未经授权,制止媒体转载。欢迎个人转发至朋友圈。

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